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BioModel - BioRom
NOMBRE: BioModel

DIRECCIÓN: http://www2.uah.es/biomodel/
AUTOR: Angel Herráez (Dpto. Bioquímica y Biología Molecular, Universidad de Alcalá)
AÑO PUBLICACIÓN O REVISIÓN: 2008
IDIOMA: Español, portugués.

UTILIZACIÓN : Como pizarra digital. También para completar y profundizar sobre aspectos de biología molecular en cualquier contexto.
BioModel


DESCRIPCIÓN:


Tal como se subtitula el portal, Biomodel son páginas de complemento al estudio de Bioquímica y Biología molecular. Es un proyecto de complemento al estudio de Bioquímica y Biología molecular mantenido por Angel Herráez Sánchez, Profesor Titular de Bioquímica y Biología Molecular de la Universidad de Alcalá  (Alcalá de Henares, Madrid, España) en colaboración con otras universidades. Nace de la colaboración de los Departamentos de Universidades españolas y estranjeras. La información es cuantiosa y variada y aporta muchas animaciones tridimensionales.

Contiene modelos moleculares en movimiento e interactivos que, junto con texto explicativo, ilustran la estructura tridimensional de las biomoléculas. Para ver Biomodel-1, 2 y 3 se necesita el conector (plug-in) Chime. Para ver Biomodel-3Java y 4 se necesita tener instalado además Java.Las visualizaciones y animaciones trabajan con los programas Rasmol y Protein Explorer basados en el plugin "Chime" y también en la "Máquina Java".

El proyecto Biomodel se puede descargar para guardarlo en Disco duro o CD dentro de otro más amplio que ocupa unos sobre 400 Mb.
Los apartados de Biomodel son:

Biomodel 1
Modelos moleculares en movimiento e interactivos. Estructura de Proteínas; Estructura del DNA; Interacción entre DNA y proteínas; Estructura del RNA; Interacción entre RNA y proteínas.
Biomodel 2
(Chime y Jmol)
Colesterol, Fosfolípido (palmitil oleil fosfatidilcolina). Modelo de bicapa lipídica y canal de gramicidina.
Biomodel 3
(Chime y Jmol)
Bioquímica estructural para Enseñanza Secundaria
1.-Glúcidos (Monosacáridos, Disacáridos, Polisacáridos)
2.-Lípidos (Ácidos grasos, Triacilgliceroles, Fosfolípidos, Esteroides, Bicapa lipidica, Vitaminas )
3.-Proteínas; Estructura primaria (Aminoácidos, Péptidos) Estructura secundaria (Hélice alfa, Hebra beta ) Estructura terciaria (Lisozima) Estructura cuaternaria (Hemoglobina)
4.-Ácidos nucleicos (Bases nitrogenadas, Nucleósidos, Nucleótidos, ADN, ARN)
Biomodel 4
(Chime y Jmol)
Estructura del ADN
A. La doble hélice elemento a elemento: pares de bases y puentes de hidrógeno
B. El código de bases
C. Las hebras y el esqueleto helicoidal
D. Los extremos del ADN y el antiparalelismo
Biomodel 5
(Chime y Jmol)
Biopolímeros
Conceptos generales de polímeros; Colágeno; Fibroína de la seda de gusano; Espidroínas de la seda de araña; Caucho; Estructura de ácidos nucleicos; Estructura de polipéptidos y proteínas; Estructura de oligosacáridos y polisacáridos; Biosíntesis de ácidos nucleicos; Síntesis química de oligonucleótidos Biosíntesis de proteínas y péptidos; Síntesis química de péptidos; Plegamiento de proteínas; Carabinas moleculares; Análisis de conformación de macromoléculas.
Estudio de ácidos nucleicos
(Este es un índice cruzado a distintas secciones dentro de Biomodel; todos los enlaces se abren en una ventana nueva)
Genoma humano
Animación en 3 dimensiones ilustra las bases de la biología molecular, mostrando el proceso por el cual las instrucciones genéticas se convierten en proteínas activas (transcripción y traducción). La película, en español, dura 3,5 minutos.
Protein Explorer
"Protein Explorer ha revolucionado la enseñanza de la biología a nivel molecular."
Diagramas animados de procesos bioquímicos
El objeto de estos esquemas es facilitar y mejorar la comprensión de los procesos bioquímicos. Son un apoyo a las clases o al estudio. La mayor parte de ellos no se explican, por lo que es preciso conocer previamente el fundamento de la técnica o cómo tiene lugar el proceso bioquímico y las moléculas implicadas en él.
Requieren Shockwave, QuickTime o Flash. (Muy interesante)
Ejercicios de autoevaluación
Estructura tridimensional de biomoléculas (énfasis en la estereoisomería)
Ejercicios de asignaturas: Preguntas, ejercicios y problemas, con respuestas y comentarios, correspondientes a las asignaturas de la Licenciatura en Farmacia, en la Universidad de Alcalá: Biología Molecular e Ingeniería Genética y Bioquímica Clínica y Patología Molecular Humana.
Citogenética
El estudio de los cromosomas
1.- Información general de citogenética
2.- Citogenética Clínica
3.- Genes, Cromosomas y Meiosis
4.- Genética del cáncer
Código genético
Representación circular del código
El proyecto biológico
Estas páginas son una traducción al español del material original en inglés
que se encuentra en The Biology Project ( http://www.biology.arizona.edu)
Se desarrollan cuestiones de Biología y Bioquímica por sucesivos problemas de preguntas y respuestas.
Colección de enlaces
Extensa colección de enlaces a páginas web útiles para la enseñanza y el aprendizaje de la Bioquímica y Biología Molecular

En la información en Internet además de estos apartados también estan:
- Tabla periódica de radios atómicos e iónicos
- BioRom 2008, Recorrido por todas las versiones de BioRom con la posibilidad de descargar la última versión de 2008.

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